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研究 | 基于ERA核酸快检和Cas12a ,检测结核分枝杆菌中的链霉素耐药基因突变


先达基因 / 2022-10-20

耐药结核病(TB)是一个严重的公共卫生问题,威胁着全球结核病的预防和控制。
我国是耐药结核高负担国家之一,据世界卫生组织估计,约有1/4-1/5耐多药结核病人发生在中国,耐药结核病的流行情况较为严重,2007~2008年开展的全国结核病耐药性基线调查结果显示,我国肺结核患者中耐多药率为8.3%,据此估算,我国每年新发耐多药患者12万例,占全球每年新发总数的24.0%,位列全球第二位。

国家传染病临床研究中心研究者扩增偶联 Cas12a 突变体的模块,通过由先达基因研发的酶促恒温扩增技术(ERA技术),开发出Cas12 检测系统,可以识别更多非传统的原始间隔区相邻基序靶向序列,可以快速治疗和预防STR耐药结核病的疾病传播,有助于减少疾病传播和死亡率。


在此次研究中,目标基因通过ERA在基因组中扩增,并被 Cas12a RR 识别。同时,Sherlock 的单核苷酸特异性也被应用于与M.tb相关的突变。STR抗性具有高灵敏度和特异性,即使目标基因含量为总样本量的0.1%,Cas12a RR也能识别该基因。

与药敏实验和基因组测序相比,Cas12a检测系统具有更高的灵敏度和特异性,整个检测过程可在60 min内完成,在样本处理上也更有优势。这为耐药结核病患者的及时诊断和治疗带来了希望。




原文:《A Recombinase Polymerase Amplification-Coupled Cas12a Mutant-Based Module for Efficient Detection of Streptomycin-Resistant Mutations inMycobacterium tuberculosisIF:6.064)》

链接:https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.796916