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研究 | IF:5.818: ERA技术助力南美白对虾虹彩病毒1型(DIV1)等温重组酶扩增快速检测方法的建立及可视化改


GenDx / 2023-07-13


导读

随着全球人口的增长和营养意识的提高,水产养殖业发展迅速,而南美白对虾是目前世界上最重要的养殖对虾。2016年发现的新病原体——十足目虹彩病毒1型(DIV1),对全球水产养殖业产生了重大影响,近年来引起了公众的关注。DIV1是一种二十面体对称病毒,其双链DNA长度约为166kbp,宿主范围广泛,目前由于缺乏有效的治疗方法,早期发现和定期监测是避免感染DIV1的最有效方法。

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研究内容

中国海洋大学海洋生物科学学院海洋遗传育种教育部重点实验室、中国海洋大学三亚海洋研究所海南省热带水产种质资源重点实验室、海洋科学与技术国家实验室海洋分子生物技术中心海洋水产科学与食品生产加工实验室、海南崖州湾种子实验室的Yan Wang、Yan Wang团队等一种新的实时定量重组酶聚合酶扩增(QERA)方法及其无需仪器的可视化改进,以快速检测DIV1。通过对DIV1 ATPase保守基因序列设计5对用于DIV1-qERA检测的引物和探针,筛选出最佳引物对、探针浓度及适宜的反应温度,确定了最佳反应条件。然后,评价其检测DIV1的能力,并与DIV1qPCR法、DIV1qERA法和DIV1ERA-SYBR Green I法的灵敏度进行比较。

研究结论

本研究中,Yan Wang、Yan Wang团队等建立的新型DIV1-qERA法和DIV1-ERA-SYBR Green I法可快速检测DIV1,具有较高的敏感性和特异性,实现检测免仪器、结果可视化,适合现场检测。DIV1-qERA法的检出限为1.0copiesµL−1,DIV1-ERA-SYBR Green I方法的检出限为1.0×103拷贝µL-1,高于定量聚合酶链式反应和定量聚合酶链式反应的检出限。DIV1-qERA和DIV1-ERA-SYBR Green I两种检测方法均可在42℃下20min内完成,与白斑综合症病毒、超高抗病毒株、超高致病毒株或超高致病性新城疫病毒均无交叉反应。这两种方法为对虾养殖场、检疫站和资源有限的基础实验室,特别是偏远和农村地区的DIV1检测提供了直接、醒目和无需设备的方法;可以根据检测现场的实际情况选择最合适的方法。此外,本研究结果可能会促进基于核酸扩增技术的DIV1检测方法的广泛应用,为水产养殖业监测和控制这一新病毒提供参考价值。



本研究中,研究团队采用的ERA超增技术(Enzymatic Recombinase Amplification,酶促恒温扩增技术)由苏州先达基因科技有限公司开发,属于恒温核酸扩增技术,可以在恒温下进行,不需要热循环





原文:《Development and Visualization Improvement for the Rapid Detection of Decapod Iridescent Virus 1 (DIV1) in Penaeus vannamei Based on an Isothermal Recombinase Polymerase Amplification AssayIF:5.818)》

作者:Yajin Xu, Yan Wang, Jingjie Hu, Zhenmin Bao and Mengqiang Wang

期刊:Viruses

DOI:10.3390/v14122752